El programa de Postgrado en Ingeniería y Ciencia de Alimentos (PPG-ECA) de la Universidade Federal do Rio Grande (FURG) comenzó sus actividades de posgrado stricto sensu en 1996 a partir de una experiencia consolidada de formación de profesionales graduados en Ingeniería de Alimentos. Para ello, contaba con un cuerpo docente que fue capacitado para atender las principales demandas del área de alimentos. El programa está vinculado a la Escuela de Química y Alimentos, unidad de la institución que, además de atender diferentes carreras, es responsable directamente por las asignaturas profesionalizantes de las carreras de grado de Ingeniería de Alimentos, Ingeniería Química, Ingeniería Bioquímica, Ingeniería Agroindustrial-Industrias Alimenticias, Ingeniería Agroindustrial-Agroquímica, Profesorado en Química y Licenciatura en Química.
Ingeniería de Alimentos se implantó en 1979 por la ordenanza nº810 publicada en el Boletín Oficial de la Nación el 18 de octubre de 1985. Después, fue aprobado por el Consejo Federal de Educación, reflejando la vocación del antiguo Departamento de Química, actual Escuela de Química y Alimentos, en el sentido de formar profesionales capacitados para actuar en el área de Ingeniería de Alimentos. En la época 4 profesores y otros 2 profesionales recién contratados actuaban en el área. A partir de 1980 los docentes del área priorizaron la continuidad de las capacitacionesen Ciencia, Tecnología e Ingeniería de Alimentos, en búsqueda de la implantación de un programa de posgrado, lo que se dio en 1996 con un número inicial de 6 docentes doctores, evolucionando hacia los 13 docentes permanentes actuales.
La estrategia para la consolidación de la vocación de capacitar a personas en el área de Alimentos tuvo inicio con la iniciación científica (1985), con el Programa Especial de Capacitación Tutorial (PET) (1991) y la creación de la carrera de posgrado lato sensu Especialización en Ingeniería de Alimentos (1994). Con esta experiencia, el grupo propuso la instauración de la primera Comisión de Carrera de Posgrado en Ingeniería de Alimentos, compuesta por profesores de los Departamentos de Química, Matemática, Física, Educación y Ciencias del Comportamiento, que propuso la transformación de la carrera de lato sensu en stricto sensu, lo que fue aprobado por los Consejos de la Universidad en 1995.
La Maestría en Ingeniería de Alimentos empezó las actividades con oferta regular de asignaturas a partir del primer semestre académico de 1996. El cambio de denominación del Programa para Maestría en Ingeniería y Ciencia de Alimentos y modificación de las 3 menciones para una única, Ingeniería y Ciencia de Alimentos, ocurrió en 2001 y fue efectuada en abril de 2002, conforme recomendación de los consultores indicados por la CAPES. Con la experiencia en evolución y la contribución de nuevos docentes capacitados, en marzo de 2004 fue aprobado por la CAPES la ampliación del Programa a nivel de Doctorado, con mención en Ingeniería y Ciencia de Alimentos. Actualmente el PPG-ECA posee 3 líneas de investigación que representan las áreas de actuación de su cuerpo docente: Bioprocesos en Alimentos, Caracterización de los Recursos Agropecuarios y Valoración de Recursos Hidrobiológicos.